АТГ нь авлигын эсрэг олон нийтийг соён гэгээрүүлэх, урьдчилан сэргийлэх арга хэмжээг зохион байгуулах, хуульд заасан албан тушаалтны хөрөнгө, орлогын мэдүүлгийг хянан шалгах, авлигын гэмт хэргийг илрүүлэх зорилгоор гүйцэтгэх ажил, хэрэг бүртгэлт, мөрдөн байцаалт явуулах ажлыг гүйцэтгэх чиг үүрэгтэй.

АТГ нь Урьдчилан сэргийлэх, соён гэгээрүүлэх хэлтэс, Хяналт шалгалт, дүн шинжилгээний хэлтэс, Мөрдөн шалгах хэлтэс, Гүйцэтгэх ажлын хэлтэс, Тамгын хэлтэс гэсэн үндсэн 5 хэлтэстэй.

АТГ-ын даргын тушаалаар байгуулагдсан Аюулгүй байдал, хяналт шалгалт, нууцын алба, Судалгаа шинжилгээний алба, Санхүү, аж ахуйн алба ажиллаж байна.